真菌性阴道炎实际是正常寄生在阴道内的细菌生态平衡（菌群）失调。生理情况下，阴道内有各种厌氧及需氧菌，其中以产生过氧化氢的乳杆菌占优势。细菌性阴道病时，阴道内乳杆菌减少而其他细菌大量繁殖，主要有加德纳尔菌、动弯杆菌及其他已成厌氧菌，部分患者合并支原体感染。其中以厌氧菌居多，厌氧菌的浓度可以是正常妇女的100~1000倍。厌氧菌繁殖的同时可产生胺类物质，碱化阴道，使阴道分泌物增多并有臭味。
健康人的口腔、阴道、消化道等处，都有念珠菌，平常不引起疾病，但当机体免疫功能低下时，如孕妇、糖尿病患者，以及长期应用广谱抗菌药，大量应用雌激素等，均可使阴道正常酸碱度改变或菌群失调，机体环境适合念珠菌生长繁殖，便侵犯寄主的组织发病。也有经过性交直接传染而致病的。
真菌性阴道炎是由于感染白色念珠菌而引起的一种阴道炎症，也有少数患者感染其他念珠菌及类酵母菌而发病。
真菌性阴道炎常见的病因：
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