预防非淋菌性尿道炎发生的关键是杜绝不洁性交。此外，公共浴堂的卫生也很重要，不提倡洗盆塘，衣服要单独存放。淋病加大了本病发病的机会，故患淋病后要积极治疗，彻底治愈。淋病治愈后要化验检查是否患有非淋菌性尿道炎。配偶一方患病后，另一方要作化验检查，发现患病后要积极治疗。
由于非淋菌性尿道炎本来症状即轻，治疗后症状就更不明显了，但不能认为本病已经治愈。也有的患者经治疗后，大夫告诉他已经治愈，但患者仍有一些不适症状。这两种情况都令人迷惑，怎样才能算治愈呢?笔者认为判定治愈的标准既不能完全根据症状，也不能不考虑患者的自觉症状。没有症状如化验检查证明仍有衣原体或支原体，也说明病情未得到控制。而患者有不适的症状，经至少3次化验检查证明均为阴性，可以说已经治愈。
非淋后期治愈标准3、荧光免疫法尿道(宫颈)标本衣原体、支原体检查阴性(有条件时)。
非淋后期治愈标准2、尿液澄清，沉渣镜检阴性。
非淋后期治愈标准1、临床症状消失1周以上，尿道无分泌物，或分泌物中白红胞≤4个/100倍显微镜。
