男女生殖器官都可以分为两类：一类是性腺，一类是附性器官。男女生殖器官中的性腺都有双重使命，一是产生精子或卵子；二是分泌性激素。性激素有助于附性器官的发育与生长。附性器官的功能是参与完成性行为和完成新生命的形成与孕育。
睾丸是男性的生殖腺，担负着生成精子和分泌雄激素的双重任务。输精管道则包括附睾、输精管、身精管和尿道等。附睾具有储存精子和使精子最终完全成熟的功能。输精管是附睾管的延续，承担着运输和储存精子的作用。射精时，精子通过上述管道后，再经尿道最终排出体外。附属腺体包括精囊腺、前列腺、尿道球腺和尿道旁腺。可别小看这些配角的作用，精液的液体成分大部分来自它们，其中包含供养精子的大量营养成分，缺了它们，精子就会失去活力和受精能力。由睾丸到输精管这一段以及附属腺体都是两侧对称的。
男性生殖系统还可以接内、外生殖器来分类，这样介绍起来更方便些。外生殖器官包括阴茎和阴囊。内生殖器包括睾丸、输精管道及附属腺体。
