一种常见性传播疾病，国内外对本病的认识时间不甚长，而且对其定义、病原体的认识也有一个逐渐发展的过程，直至今日，有很多人认识尚待提高，本病病原体的感染是宫颈炎、盆腔炎症性疾病（Pelvic inflammatory disease,PID)、附睾炎最常见的病原体、反复发作的支原体感染可致包括子宫内膜炎、输卵管炎、习惯性流产、绒毛膜羊膜炎，最终导致不孕。更为严重的是，这些病原体中有些还可以通过母婴途径导致新生儿感染，影响到下一代健康，造成严重的社会问题。中西医对本病均有较多的治疗方法，但也存在尚需解决的问题。
鉴于非淋性病的潜伏期长达1-5周，尚且有很大一部分感染者无任何临床症状，所以及早发现感染源并阻断传播途径是预防关键。要提高临床检验水平；发现病例后，追访性伴并予以诊治是在具体工作中应重视的环节。 对于如何增强非淋性病患者的免疫力，提高对本病的免疫力是中医药日后加强对本病防治工作尚需解决的问题，有的学者检测了非淋菌性尿道炎患者的淋巴细胞转化实验（LBT）均有不同程度的降低，说明患者多有免疫力下降。那么很多中药均有提高免疫力，最终杀死病原体，从而使发病率和再发率明显降低，应是中医药临床、基础研究人员关注的问题之一。
难点之一：非淋性病如何降低患病率非淋菌性尿道炎是一种临床上常见的性传播疾病，为了控制性病继续流行，应当根据预防为主、防治结合、综合治理的原则，制定完善的适合当地的性病防治规划，其目的在于：（1）中断性病的传播：（2）预防性病及其并发症、后遗症的发生。所以，很明显，它的预防不仅是一个医疗问题，而且是一个社会问题。引起NGU较广泛流行的原因之一，可能与支原体等感染后自觉症状较轻，就诊率低也有关系，而造成容易漏诊，形成隐患。或因患者或一些医生用药不当引起迁延性感染。不同地区、或不同的病原体对药物的敏感性差异较大，由于用药不当就会错过临床治疗的最佳时机，造成慢性迁延性，危害甚广。此外，忽视对其性伴侣诊治，也是造成反复感染的因素之一。 为了达到上述目的，需要加强组织领导，制定防止规划，提供资源，建立专门的性病防治机构，进行性病监测、培训人员、开展宣传教育、进行医疗干预、组织科学研究和制定必要的法规等。这些对策是相互联系和彼此促进的。凡是性传播疾病，都应标本兼顾，综合治疗。急则治标，较易进行，改变患者讳疾忌医，使其及早治疗，提供方便和有效的服务，同时通知其性伴也能就医。治本，特别是改变高危人群多性伴性行为（包括打击卖淫嫖娼），将是长期的目标，预防工作中要宣传正确的性爱观，洁身自爱，实行安全的性行为，包括使用阴茎套等屏蔽的方法，做好个人防护，要利用医疗单位提供宣传教育的机会。 预防本病的发生和患者的再感染，前提是病者有健康的生活方式，良好的性爱观念及具备一定的医疗保健知识，其次才是医护、防疫人员的介入，医疗措施的干预
本病在西医的治疗多选用四环素抗生素（如四环素、强力霉素、去甲金霉素、美满霉素），喹诺酮类（如环丙沙星、二氟沙星、氧氟沙星、司帕氟沙星、诺氟沙星、洛美沙星），大环内酯类（如红霉素、螺旋霉素、美欧卡霉素、罗红霉素、阿齐霉素、克拉霉素等），但总的来说，对本病的治疗目前尚无统一认识，特别是用要方式、剂量与时间没有完全一致的意见，而且这些药物虽然有较好疗效，却有普遍存在对这些药物的耐药菌株增加，药物副作用，复发率较高等问题。如：有文献报道对支原体感染的非淋菌性尿道炎用经典红霉素的治疗失效率可高达37%，四环素耐药大幅度增加，环丙氟派酸治疗复发率高达58%，即使大剂量也难提高疗效。抗生素对非淋菌性尿道炎的病原体出现了普遍的耐药，对此有的学者主张联合应用各种不同类型抗生素，也有人认为这样虽可提高疗效，但也可能是耐药性上升。在临床中我们常采用在一般方法的基础上加服灭滴灵而达到提高疗效和减少复发的目的。因为NGU发生是多因素造成的，灭滴灵既可杀灭毛滴虫，也可对各种厌氧菌感染有良好的效果，而未出现耐药菌株，不易引起菌群失调，与常用抗生素之间无拮抗作用。
难点之二：如何减少非淋菌性尿道炎在治疗上的复发
对于防止非淋菌性尿道炎的复发的关键是及早发现，及早诊断，及早治疗。各种病原体混合感染可以增加治疗难度，增加耐药的可能性。所以疗程要规范，剂量足够大。中医治疗本病比较晚，但其治疗具有复方制剂，不易产生耐药菌株；可与西药协同，提高疗效；在西医西药受到限制的某些情况下（例如妊娠），仍可使用中医中药进行治疗；且副作用小，具有简便安全的优点。有条件者应在治疗前做病原体检查，并做药敏实验，选用敏感性药物，有效而及时杀灭病原体。在疗程结束，症状消失后，应复查病原体，若仍为阳性者，应分析原因，采取相应的措施。对疗程不足者，应给予不足量治疗，对耐药应及时调整使用敏感性药物。
