内膜移植：即由于人为和或内在的原因致使内膜被移植到其他部位。从人为因素来讲，如子宫切除、剖腹产、人工流产等宫腔手术致使含有内膜的宫腔血液被移植到腹腔等其他器官所致。从内在因素来说，如阴道闭锁、宫腔狭窄、子宫后倾等生殖器官异常导致经血倒流，使经血中含有的内膜组织在其他部位生长。外在性的子宫内膜异位症多是这种原因生成的，这也是临床上最为多见的一种致病原因。
子宫内膜异位症病因是一个复杂而深奥的疾病。虽然也可以发生在胸膜、肺脏、脐部、四肢、肌肉、脑膜、心包等处，但大多数是发生在盆腔脏器。就其症状来说，主要有痛经、月经紊乱、不孕、阴道或宫颈痛疼、少数人有低烧等，也有不少人没有明显症状。在这些症状中，最为直接和明显的就是痛经，这也是子宫内膜异位症最主要的症状，痛经对于诊断子宫内膜异位症有特征性的意义。
子宫内膜异位症病因与遗传、免疫功能、内分泌以及某些妇科疾病有关。其发生的机理主要有内膜移植、直接蔓延、组织生化以及静脉或淋巴管迁移几种。
子宫内膜异位症可分为内在性和外在性两种。如果子宫内膜只发生于子宫肌层，而且是散在的，称子宫肌腺症，如果形成局限性肿块，则称子宫肌腺瘤，这两者均属于内在性子宫内膜异位症。如异位的子宫内膜出现于子宫以外的器官或组织，通称为外在性子宫内膜异位症，或称为巧克力囊肿。
组织生化：由生理学可知，人体在胚胎发育时期，卵巢表面上皮、腹膜、阴道直肠膈、脐部均由体腔上皮化生而来，这些组织在性腺激素、炎症、机械因素的刺激下能够转化，形成另一种组织，同样可以化生为子宫内膜，因为不在宫腔，就成了异位的内膜。从而发生子宫内膜异位症。此种情况在临床上亦不多见。
直接蔓延：由宫颈直接蔓延而出现子宫肌层的内膜异位症，这是一种内在性子宫内膜异位症，临床上并不多见。
静脉或淋巴管迁移：即通过血液循环或淋巴系统将子宫内膜碎屑转移停留在某脏器或组织上而发病，如发生在肺、膀胱、肠道等部位的子宫内膜异位症多是这样形成的。此种情况在临床病例中较为少见，是一种较为罕见的发病原因。
严格地讲，并不只是来月经的那几天肚子疼才叫痛经，应该是来月经的前两天一直到月经结束后的两天这段时间的疼痛都属于痛经。作为一个育龄妇女，如果有痛经而且合并有其他问题时，就要想到自己有子宫内膜异位症的可能。所谓合并有其他问题是指，月经出现提前和推后等不正常现象、经期延长或缩短、痛经和以前的痛经有一些异样变化等等，还有就是就是来月经的同时有肛门的促胀、腹泻等，痛经加上这些合并症状，就要充分考虑有子宫内膜异位症的可能了。此外，不孕也是子宫内膜异位症的一种症状。对一个妇女来说，如果没有别的原因而发生不孕，也要考虑是不是有子宫内膜异位症的问题。据临床统计，十个存在慢性盆腔疼痛的女性中有八个人是子宫内膜异位症；十个不孕的女性中，有三个是子宫内膜异位症所致。
