非淋球菌性尿道炎衣原体和支原体可持续数月之久，容易发生并发症，应查明病因后作针对性治疗。一般采用广谱抗菌素疗法，如四环素、强力霉素或红霉素对沙眼衣原体治疗效果较好。中医对于该病的治疗主要是清热解毒利湿杀虫，我们多用中药“前舒安”进行治疗，效果比较显着。
对于非淋球菌性尿道炎应与淋球菌性尿道炎相区别。淋病潜伏期为3--5天，排尿困难多见，尿道分泌物量多，呈脓性，化验时可发现白细胞内革兰氏阴性双球菌为阳性。而非淋球菌性尿道炎尿道分泌物多为浆液性或粘液脓性，比较稀薄，分泌的量也少，需用少挤压尿道才有分泌物流出。如果无明显的尿道分泌物，医生常用清晨首次尿或距末次排尿后2--3小时的尿做沉淀离心。也可以通过酶免疫的检查法及染色法、培养法等来进行区别。
非淋球菌性尿道炎好发于青年性旺盛时期，一般男性多于女性，潜伏期可由数天至数月，但多数为1--3周，男性非淋球菌性尿道炎可分为单纯性的和有并发症的两种，单纯性非淋球菌性尿道炎常表现为尿道内的不适、发痒、刺痛或烧灼感。病情时重时轻。但疼痛的程度比淋病轻。分泌物为浆液性或粘液脓性，比淋球菌性尿道炎的分泌物稀薄。当长时间不排尿，或早晨首次排尿前有时能见到逸出尿道口的分泌物污染内裤，尿道口可红肿，但不象淋病那样显着。但也有不少病状并不明显，约有一半的病人在初诊时易被误诊，被当作“慢性”淋病或耐青霉素淋球菌感染处理，长期不显效果。有并发症的患者可能会出现前列腺炎、附睾炎、睾丸焱 等等，并且可能产生性功能障碍、不育等其它合并症。
非淋球菌性尿道炎产生的原因非淋球菌性尿道炎可由多种病原体引起，其中以叫做沙眼衣原体和支原体为多。沙眼衣原体约占40%--50%，支原体约占20%--30%。其它如阴道毛滴虫、白色念球菌、疮疹病毒等病原体，也可引起非淋菌性尿道炎。尿素分解支原体和人型支原体统称为生殖系支原体，不仅是非淋球菌性尿道炎的重要病原体，而且与女性内生殖器官炎症及不孕症、产褥热、自然流产、死胎及早产有重要关系。
非淋球菌性尿道炎，这是尿路感染中最为常见的病症。因为它主要由淋球菌以外的其他病原体如支原体和衣原体等通过性接触传染所引起，所以，又统称为非淋球菌性尿道炎。近年来，非淋球菌性尿道炎发病例数不断增加，已成为除淋病、梅毒以外最常见的性传播疾病之一。许多发达国家估计每年的非淋球菌性尿道炎的发病人数约占整个尿道病人数的一半以上。
