但有些乙肝患者用药却不宜长期使用，要避免延长给药时间，减少蓄积中毒、病毒耐药性、药物依赖性等不良反应的出现。例如乙肝患者一旦感冒发烧，消炎药物使用一定要采取“短平快”原则，做到病除药止。
适当的疗程 按照治疗学原则，规定药物治疗的周期。抗乙肝病毒治疗和抗肝纤维化治疗都是需要长期坚持不懈的，疗效明显时，不能擅自停药，必要时延长治疗，以获得稳定持久的疗效。例如用拉米夫定和干扰素治疗乙肝，疗程需要在1年以上。
适当的病人 治疗乙肝强调个体化、因人施治的原则，譬如干扰素的治疗对象，一定要求病情处于转氨酶升高、乙肝病毒复制指标阳性的患者；重度或重型的乙肝患者不宜使用干扰素治疗。
适当给药途径 必须综合考虑用药目的、药物性质、病人身体状况以及安全经济、简便等因素。口服给药既便利，又经济，而且病人少受痛苦，相反静脉滴注不提倡轻易采用。
适当的剂量 干扰素治疗乙肝非常普遍，剂量的把握十分讲究。如果剂量太小，难以奏效；如果剂量太大，药物毒作用过强，患者身体难以承受。一般认为中国人的合适剂量为 500万～600万单位／隔日1次使用。适当的时间 例如长效干扰素每周使用1次，可以确保一周内患者血液中药物浓度基本保持在有效范围内，可以给患者减少痛苦和麻烦。
适当的药物 根据疾病与患者机体条件，权衡多种因素利弊，选择同类药物中最为适当的药物。例如早期肝硬化患者，选择抗病毒联合抗肝纤维化药物同时使用，疗效最好。
乙肝患者用药掌握适当性合理用药适当性原则主要体现在以下几个方面：
许多新药远期疗效未定，加上价格十分昂贵，不宜作为一线药物推荐试用。例如阿德福韦，国家药监局尚未正式批准该药进口上市，不少患者听说这种药物疗效好，可以替代拉米夫定，于是耐不住性子，四处打探求药。有的还从海外自行购药试用，耗资巨大，但是缺乏指导，对于用药的注意事项、剂量、疗程等一概不知，用药后期的不良反应难以预测。
提倡经济性治疗乙肝花费大、药物贵是众所周知的，乙肝患者病情反复无常，用药不断，不少患者因病致贫。因此乙肝患者用药一定要精打细算，少花冤枉钱。例如具有保肝降酶功能的药物非常多，选择用药时，一定要考虑到经济承受能力，货比三家，选择价廉物美的药物，如甘利欣注射液。
另外，成百上千种所谓“保肝药物”，只有一部分具有改善肝功、减轻肝脏炎症反应的作用。所以患者用药，必须认真选择，千万不能草率鲁莽，万不可轻信广告和其它各种宣传。
追求有效性现在不少乙肝老药，例如口服的泛昔洛韦、无环鸟苷等已被证实为无效，现已逐渐淘汰。目前作为治疗乙肝的主打药物――抗乙肝病毒药物，公认的只有干扰素、拉米夫定等几种，其他标榜具有抗乙肝病毒性质的药物，目前尚未得到一致认可。
中药也同样存在着不安全因素。有些中草药和中药制剂被证实具有明显的肝损作用，例如中草药苍耳子、贯众、雷公藤、天花粉、肉豆蔻、薄荷、川楝子等；中成药有小柴胡汤、复方青黛丸、消核片、克银丸等。因此，要避免滥用和超期、超量服用，对于民间验方、偏方一定要慎用，以防中毒。有药物过敏史或属过敏体质的患者，一旦出现药物性肝损害，一定要终止该药物使用，及时前往正规医院诊疗。
讲究安全性治疗乙肝用药首先要强调安全性，乙肝患者病情易变化，疗程漫长，单一用药难以达到治疗目的，现多采用联合治疗，用药安全是首要的。多年以前曾经使用的多种肝炎用药，后来被证实是不安全的，例如阿糖腺苷、膦甲酸等，都有可能引起肾功能损害。目前使用的干扰素、拉米夫定等，同样存在严重的安全隐患，如果使用不当，选择不当或擅自停药都可能导致病情加重。
目前，治疗乙肝尚存在许多不合理的乙肝患者用药情况，大约20％～30％乙肝患者病情加重与不合理用药有关。不少病人因为误治、乱治以及“自治”导致病情加重。因此，乙肝用药需要掌握“四项原则”：
